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一理論,並在1935年關於冰的摘值的論文中集中運用了這一理論。

現在莫斯基的變性實驗使鮑林進一步確信,氫鍵是蛋白質結構中一個重要的成分。1935年秋天,他們兩人根據鮑林的思路初步提出了一種新理論。他們寫道:“我們對一個自然的蛋白質分子(表現出一定的特性)的認識如下。分子包含一個多肽鏈,在整個分子中連續不斷(或者在某些情形下,包含兩條或更多的多肽鏈);這一多肽鏈被摺疊為由氫鍵鍵合的唯一的結構。……”換句話說,所有蛋白質都包含氨基酸環,以及可能以阿斯特伯裡認為的原始蛋白質角蛋白形式存在的多肽鏈。強肽鍵使整個鏈成為一個整體,但是各部分之間較弱的氫鍵摺疊之後使整個鏈成為其最終的形狀。這最終的形狀對蛋白質的功能是至關重要的;分子除非保持這一形狀,不然難以完成其功能。稍微受熱之後,氫鍵斷裂,整個鏈條伸長,並像針線盒中鬆散的紗線那樣糾結在一起。然而,只要整個鏈還是一個整體,在合適的條件下,氫鍵能夠重建,蛋白質也能恢復原先的形狀和活性。較強的處理將使鏈本身斷裂,打破肽鍵,並不可逆轉地使蛋白質變性。

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