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李驍定睛一看,“臥槽!這是啥?”

系統沒有回答。

李驍趕緊開啟這本只有300多頁的書籍,進行了一番翻閱,發現理『性』分子設計主要是在計算機中完成。透過計算機建模預測蛋白質活『性』位點,考察某基因突變對目標蛋白穩定『性』、摺疊以及與底物結合的影響,從而對蛋白質進化進行設計指導和模擬篩選實驗,提高實驗的成功率。

具體說來,就是為基於目標蛋白的三維結構,利用計算機理『性』設計親和配基提供了便利,使其成為更加快速的獲得高親和『性』肽配基的有效方法。

該方法一般包括以下步驟:

1.透過蛋白質資料庫或同源模建的方法獲得目標蛋白質的相關結構資訊。

2.基於經驗或分子模擬軟體分析找到潛在的配基結合位點,這個位點可能是蛋白質的活『性』點,也可能是它的天然互補配基結合位點,或者是溶劑暴『露』區域等。

3.建立一個含有大量候選分子的資料庫,也可以利用商業化的資料庫,如常用的劍橋結構資料庫和現有化學品目錄資料庫等。

4.利用分子對接軟體進行配基的篩選,獲得與目標蛋白具有較高親和『性』的配基。

5.最後利用分子顯示和分子『性』質分析軟體評價所獲得的配基和目標蛋白的親和『性』。

……

李驍呆了一呆,忽然激動地道:“明白了!用《理『性』分子設計》的方式,我就能設計一種建模,對人類現有的5000種酶進行分析,並找到那種可能的酶的結構分子式。”

只要這種酶的結構分子式得到,就能人工合成這種酶,那座茫茫大海中的小島也就能找到了。

至於建模的原則,對於李驍而言並不是難題,他已經有了肌纖維圖紙,能夠得出炎症細胞的基因特徵,再把5000種酶的資料輸入進去,足以構建起數學模型。

現在唯一的難題,就是igem大賽報名截止還有半個月,他要在那之前拿出基本的方案,才能申報。

他需要再一次和時間賽跑了!想和更多志同道合的人一起聊《學霸的超基因系統》,微信關注“優讀文學 ”看小說,聊人生,尋知己~

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